Para poder reconfigurar la placa de video tenemos tres formas a saber:

Si tenemos una placa de video Nvidia o Ati podemos instalar facilmente los drivers de estas placas con el programa Envy que lo pueden descargar directamente desde la pagina del autor y como es un .deb le hacen doble click y listo ya lo tienen instalado.
Para descargar hacer clik en el siguiente enlace:
albertomilone.com/ubuntu/nvidia/scripts/ubuntu/envy_0.9.9-0ubuntu1_all.deb

Luego van a Aplicaciones>Herramientas de sistema>Envy
Eligen la placa que tienen y le dan instalar el driver automaticamente, cuando el programa le pregunte si dejan que el programa modifique el archivo xorg.conf, le dicen que si, luego reinician la secion y listo.

Si lo anterior no funciona deben hacer los siguiente, y es compilar los modulos a mano del driver Nvidia, para lo cual van a seguir los pasos que figuran en mi Howto qu tiempo atras hice en Psicofx y que no voy a volcer a escribir aca por ovbias razones, pero si pondo el link para que lo lean:
www.psicofxp.com/forums/gnu-linux.50/594575-instalando-los-modulos-de-nvidia.html

Ahora si todo esto no funciono es hora de volver atras y dejar los driver genericos de Linux para poder seguir buscando una solucion mas hacertada y lo hacemos con el siguiente comando desde una consola, que siempre es mejor cuando arranca el sistema y antes que arranque el grub, precionado escape antes de que se cargue el Grub:
dpkg-reconfigure xserver-xorg
Es bastante intuitivo y no deberia dar demaciados problemas.